Hola Dani2012, claro que si hay muchas formas, en ecualug.org ya hay un hilo que trata sobre este tema de migracion, http://www.ecualug.org/2012/02/15/zimbra_migrar_emails_de_un_servidor_otro#comment-59230 de todas formas te ofrezco un metodo para migra e incluso programar tus respaldos de zimbra

Hola amigos Soy Venezolano de Boconó estado Trujillo. Quiero compartir con ustedes un script que me ha funcionado del todo bien, Lo estoy utilizando con Debian GNU/Linux 5.0.10 (lenny) Kernel 2.6.26-2-486 y Zimbra 6.0.16 GA Release. Partiendo del script al inicio del foro, lo modifique para que de una servidor a otro migre por lotes las cuentas de cada usuario, utilizando la clave y usuario de admin de la consola zimbra, en este caso lo estoy utilizando con 2500 cuentas de correo, los dos servidores o equipos son idénticos en cuanto a sistema operativo y kernel. Además estoy aprovechando esta funcionalidad para realizar los respaldos del correo en otro servidor y así garantizar el servicio en caso de falla.

creamos un archivo migracion.sh y pegamos lo siguiente:

#!/bin/bash

logfile="imapsynlog.txt"

host1=10.40.25.8
#host1 is Source

host2=10.40.10.65
#host2 is Dest
domain=midominio.gob.ve
#domain is where email account is
#everything after @ symbol

###### Do not modify past here
#######################################

date=`date +%X_-_%x`

echo "" >> $logfile
echo "------------------------------------" >> $logfile
echo "IMAPSync started.. $date" >> $logfile
echo "" >> $logfile

{ while IFS=';' read u1; do
user=$u1
echo "Syncing User $user"
date=`date +%X_-_%x`
echo "Start Syncing User $u1"
echo "Starting $u1 $date" >> $logfile
imapsync --maxsize 52428800 --buffersize 52428800 --fastio1 --fastio2 --nofoldersizes --nosyncacls --subscribe --syncinternaldates --noauthmd5 --authmech2 PLAIN --exclude '(?i)\b(Junk|Spam|Trash)\b' --regexflag 's/\\\\(?!Answered|Flagged|Deleted|Seen|Recent|Draft)[^\s]*\s*//ig' --regextrans2 's,:,-,g' --regextrans2 's,\",'\'',g' --regextrans2 's,\s+(?=/|$),,g' --regextrans2 's,^(Briefcase|Calendar|Contacts|Emailed Contacts|Notebook|Tasks)(?=/|$), $1 Folder,ig' --host1 $host1 --host2 $host2 --user1 "$user" --user2 "$user" --authuser1 "admin" --password1 "1234abc" --authuser2 "admin" --password2 "1234abc" --regextrans2 's,\",-,g' --regextrans2 's,&AAo-|&AA0ACg-|&AA0ACgANAAo-(?=/|$),,g' --ssl1 --authmech1 PLAIN --ssl2
date=`date +%X_-_%x`
echo "User $user done"
echo "Finished $user $date" >> $logfile
echo "" >> $logfile

done ; } < userlist.txt

date=`date +%X_-_%x`

echo "" >> $logfile
echo "IMAPSync Finished.. $date" >> $logfile
echo "------------------------------------" >> $logfile

lo guardamos
ahora debemos crear el archivo userlist.txt y debe contener:

fperez
cmatos
loropeza
fsantos

guardamos el archivo userlist.txt en la misma dirección donde tenemos el script. Nota: el archivo solo debe contener el nombre de la cuenta sin la @ y una sola cuenta por linea, claro amigos si necesitan también importar por lotes los password la nomenclatura seria usuario;password ejemplo lmendez;123456 (solo una cuenta por linea sin colocar nada al final de cada linea), y habria que modificar el script, si lo necesitan también puedo publicarlo.

Este es mi blog para mas información http://simongraterol.blogspot.com/